據《台灣縣志》記載：「保生大帝長大後，專於醫藥，以活人為心，按病投藥遠近皆以為神。」因此民間就有許多他習醫的傳說，留傳最廣的傳說就指出他十七歲時，有一天在海邊賞月，突然出現了一位神仙，由天而降，帶他駕著祥雲前往崑崙山，拜見西王母，西王母見他聰穎過人，懷有一顆濟世之心，因此就傳以神方濟世和驅魔逐邪的工夫，並贈送他一本珍貴的醫書。他返家後潛心修習醫術，幾年後，他便外出遊歷名川、大山；印証所學醫術，所以能有妙手回春之醫術。